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# macro file of Gorad for system testing
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# Set verbosities
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/control/saveHistory
/run/verbose 1
/control/verbose 2
/event/verbose 0
/tracking/verbose 0
/process/verbose 0

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# Geometry of the simulation
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/gorad/geometry/selectGDML simpleCone.gdml
##/gorad/geometry/selectGDML orion.gdml

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# Define geometry importance biasing
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/gorad/bias/geomImportance 5 

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# Physics of the simulation
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/gorad/physics/EM Op_0
/gorad/physics/Hadronic FTFP_BERT
/gorad/physics/cuts/setParticleCut gamma 1.0 mm
/gorad/physics/cuts/setParticleCut e- 1.0 mm
/gorad/physics/cuts/setParticleCut e+ 1.0 mm
/gorad/physics/cuts/setParticleCut proton 1.0 mm

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# GORAD and Geant4 initialization
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/gorad/initialize

# If you use radioactive decay, then uncomment the following UI command,
# in order to set a very high time threshold to allow all decays to happen
#/process/had/rdm/thresholdForVeryLongDecayTime 1.0e+60 year

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# Selection of primary particle source
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/gorad/source/define proton King.spec LW 
##/gorad/source/define proton Trap.spec LW 
##/control/execute gps_point.mac
##/control/execute gps_focus.mac

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# Define probes and scorers
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/score/create/probe Probes 5 cm
/score/probe/material G4_WATER
/score/probe/locate 0 0 0 cm
/score/quantity/doseDeposit dose mGy
/score/quantity/volumeFlux volFlx
/score/quantity/volumeFlux protonFlux
/score/filter/particle protonFilter proton
/score/close

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# Define histograms for batch mode
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/control/doifBatch /gorad/analysis/verbose 0
/control/doifBatch /gorad/analysis/file KingSpecBias
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/primary primPE false
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/config 100 1.0 2.0e3 MeV log
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/yaxisLog true
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/primary Weighted true
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/config 100 1.0 2.0e3 MeV log
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/yaxisLog true
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/spectrum Probes volFlx
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/config 100 1.0e-2 2.0e3 MeV log
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/yaxisLog true
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/spectrum Probes protonFlux
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/config 100 1.0e-2 2.0e3 MeV log
/control/doifBatch /gorad/analysis/1D/yaxisLog true
/control/doifBatch /gorad/analysis/plot -1
/control/doifBatch /analysis/plot/setLayout 1 2

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# Run for batch mode
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/control/doifBatch /run/eventModulo 0 1
/control/doifBatch /run/beamOn 100000
/control/doifBatch /score/dumpAllQuantitiesToFile Probes Probes.csv

exit